היה אב”ד בבריסק ובלודמיר, מרביץ תורה בעיר בריסק, פרנס בוועד ארבע ארצות. נפטר בלודמיר, כ”ה בתמוז שפ”ב (1622). על מצבתו חרותות המילים:
“פה נטמן צנצנת המן רועה נאמן
פרנס הדור פרי עץ הדר התקין עצמו בפרוזדור
צבי ישראל והדרו, לא נמצא חכם ונבון כמוהו בדורו
גם במעלות ובמידות והיה פארו בתורה ובמצוות
נכסף מלוא חפנים מהם אסף ויגוע ויאסף
מוהר”ר אפרים ב”ר יוסף (יונה) ז”ל תנצב”ה.
אביו של ר’ אפרים נפתלי הירש היה רבי יוסף יונה דור שישי לר’ יעקב וייל (מהרי”ו).
אביו של ר’ יונה היה המקובל רבי קלונימוס קלמן, ר”מ בקראקא ובבריסק. נפטר בשנת של”ח (1578).
אביו של ר’ קלונימוס קלמן היה רבי יונה אב”ד אוסטראה ומדינת רוסיה הקטנה. תלמיד ר’ יעקב פולק. נפטר בשנת ש”י (1550).
אביו של רבי יונה היה רבי קלונימוס קלמן.
אביו של ר’ קלונימוס קלמן היה רבי יונה ב”ר ישראל מרגנשבורג. מגדולי הפוסקים באשכנז בדורו.
ר’ יונה תלמידם של רי יעקב וייל (מהרי”ו), של רי ישראל איסרליין בעל תה”ד, , ושל ר’ אנשל סג”ל, וחברו של ר’ ישראל ברונא, הרביץ תורה ברגנשבורג. ספרו “איסור והיתר הארוך (בקיצור: או”ה) שימש כספר יסודי בהוראה, כלולים בו שישים שערים בדינים השייכים לשולחן ערוך “יורה דעה”, הלכות הגעלת כלים ופיקוח נפש בשבת ויום הכיפורים. הוא מהווה יסוד בהוראת איסור והיתר לכל בני אשכנז. נדפס בפירארה בשנת שט”ו ובפראג בשנים תקמ”ח. ר’ יונה נפטר בשנת רס”ה (1505).