תלמיד אביו. מראשי ועד ד’ ארצות, מחבר ספר “באר מים חיים” (קרקא שע”ו), שהוא פירוש על התורה ועל רש”י שעל התורה. בראש הספר באים עשר הסכמות מגאוני דורו ובראשם גיסו המהר”ם מלובלין. בהקדמתו לספר מציין המחבר שרוב הדברים שבספר מה ששמע מאביו מדי שבת כשהיה סמוך על שולחנו בימי חורפו.
אחותו של רבי יעקב, אסתר אשת רבי מאיר ב”ר גדליה, הוא המהר”ם מלובלין (שי”ח-שע”ו), תלמידו וממלא מקומו של חותנו באב”ד קרקא, וכידוע היה רבם של גדולי ישראל בדורו “ר”מ ואב”ד באומה הישראלית”. חידושיו ופירושיו נדפסים בכל הוצאות הש”ס עד היום הזה, וספר שו”ת שלו מהורה גם הוא ספר יסוד בספרות השו”ת. ראוי לציין שכמעט בכל תשובותיו הוא כותב: חתן המלך מהרי”צ כהן שפירא.